Variant Eta du SARS-CoV-2

Le variant Eta est un variant du SARS-CoV-2, le virus qui cause la COVID-19. Le variant Eta ou lignée B.1.525, également appelé VUI -21FEB-03 (anciennement VUI-202102/03) par la Public Health England (PHE), et anciennement connu sous le nom de UK1188, 21D ou 20A/S:484K, ne porte pas la même mutation N501Y que celle trouvée dans les variants Alpha, Beta et Gamma, mais porte la même mutation E484K que celle trouvée dans les variantes Gamma, Zeta et Beta, et porte également la même délétion ΔH69/ΔV70 (une délétion des acides aminés histidine et valine en positions 69 et 70) que dans Alpha, variant N439K (B.1.141 et B.1.258) et variant Y453F (cluster 5)[1].

Description

Le variant Eta diffère de tous les autres variants en ayant à la fois la mutation E484K et une nouvelle mutation F888L (une substitution de la phénylalanine (F) par la leucine (L) dans le domaine S2 de la protéine de pointe). Au 5 mars 2021, il avait été détecté dans 23 pays[2],[3],[4]. Il a également été rapporté à Mayotte[2]. Les premiers cas ont été détectés en décembre 2020 au Royaume-Uni et au Nigéria, et au 15 février, il était majoritaire parmi les échantillons de ce pays[4]. Au 24 février, 56 cas avaient été identifiés au Royaume-Uni. Le Danemark, qui séquence tous ses cas de COVID-19, a trouvé 113 cas de ce variant du 14 janvier au 21 février 2021, dont sept étaient directement liés à des voyages à l'étranger au Nigéria[3].

Dans le cadre du schéma de nommage simplifié proposé par l'Organisation mondiale de la santé, la lignée B.1.525 a été dénommée variant Eta.

Voir aussi

Références

  1. (da) « Delta-PCR-testen », Statens Serum Institut, (consulté le )
  2. a et b « GISAID hCOV19 Variants (see menu option 'G/484K.V3 (B.1.525)') », GISAID (consulté le )
  3. a et b (da) « Status for udvikling af SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) i Danmark », Statens Serum Institut, (consulté le )
  4. a et b « B.1.525 », cov-lineages.org, Pango team (consulté le )
v · m
SARS-CoV-2 et Covid-19
Généralités
Diagnostic
Transmission
Traitements
Vaccin
Variants
Classification
v · m
Ordre : Nidovirales
Alphaletovirus (en)
Milecovirus
  • Microhyla letovirus 1
Alphacoronavirus
Amalacovirus
  • Alphacoronavirus AMALF
Colacovirus
  • Bat coronavirus CDPHE15
Decacovirus
  • Alphacoronavirus CHB25
  • Alphacoronavirus WA3607
  • Coronavirus de chauve-souris HKU10 (en)
  • Alphacoronavirus de Rhinolophus ferrumequinum HuB-2013 (en)
Duvinacovirus
Luchacovirus
  • Lucheng Rn rat coronavirus
Minacovirus
  • Mink coronavirus 1
Minunacovirus
  • Coronavirus de Miniopterus(en)
  • Coronavirus de Miniopterus HKU8 (en)
Myotacovirus
  • Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011
Nyctacovirus
  • Alphacoronavirus HKU33
  • Alphacoronavirus WA2028
  • Alphacoronavirus de Nyctalus velutinus SC-2013 (en)
  • Coronavirus de Pipistrellus kuhlii 3398 (en)
Pedacovirus
Rhinacovirus
Setracovirus
Soracovirus
  • Sorex araneus coronavirus T14
Sunacovirus
  • Suncus murinus coronavirus X74
Tegacovirus
Betacoronavirus
Embecovirus
Hibecovirus
  • Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013
Merbecovirus
Nobecovirus
Sarbecovirus
Deltacoronavirus
Andecovirus
  • Wigeon coronavirus HKU20
Buldecovirus
  • Bulbul coronavirus HKU11 (en)
  • Common moorhen coronavirus HKU21
  • Coronavirus HKU15 (PorCoV HKU15)
  • Munia coronavirus HKU13
  • White-eye coronavirus HKU16
Herdecovirus
  • Night heron coronavirus HKU19
Gammacoronavirus
Brangacovirus
  • Goose coronavirus CB17
Cegacovirus
Igacovirus
Alphapironavirus
Samovirus
  • Alphapironavirus bona
v · m
Généralités
Conséquences
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