KRAS

KRAS
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

4WA7, 1D8D, 1D8E, 3GFT, 4DSN, 4DSO, 4EPR, 4EPT, 4EPV, 4EPW, 4EPX, 4EPY, 4L8G, 4LDJ, 4LPK, 4LRW, 4LUC, 4LV6, 4LYF, 4LYH, 4LYJ, 4M1O, 4M1S, 4M1T, 4M1W, 4M1Y, 4M21, 4M22, 4NMM, 4OBE, 4PZY, 4PZZ, 4Q01, 4Q02, 4Q03, 4QL3, 4TQ9, 4TQA, 4DST, 4DSU, 5F2E,%%s2MSC, 2MSD, 2MSE

Идентификаторы
ПсевдонимыKRAS, C-K-RAS, CFC2, K-RAS2A, K-RAS2B, K-RAS4A, K-RAS4B, KI-RAS, KRAS1, KRAS2, NS, NS3, RALD, RASK2, K-ras, KRAS proto-oncogene, GTPase, c-Ki-ras2, OES, c-Ki-ras, K-Ras 2, 'C-K-RAS, K-Ras, Kirsten RAt Sarcoma virus, Kirsten Rat Sarcoma virus
Внешние IDOMIM: 190070 MGI: 96680 HomoloGene: 37990 GeneCards: KRAS
Расположение гена (человек)
12-я хромосома человека
Хр.12-я хромосома человека[1]
12-я хромосома человека
Расположение в геноме KRAS
Расположение в геноме KRAS
Локус12p12.1Начало25,205,246 bp[1]
Конец25,250,936 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
6-я хромосома мыши
Хр.6-я хромосома мыши[2]
6-я хромосома мыши
Расположение в геноме KRAS
Расположение в геноме KRAS
Локус6 G3|6 77.37 cMНачало145,162,425 bp[2]
Конец145,195,965 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • trigeminal ganglion

  • mucosa of sigmoid colon

  • mucosa of pharynx

  • tail of epididymis
Наибольшая экспрессия в
  • left colon

  • medullary collecting duct

  • conjunctival fornix

  • cumulus cell

  • endothelial cell of lymphatic vessel

  • left lung lobe

  • medial ganglionic eminence
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • нуклеотид-связывающий
  • LRR domain binding
  • GDP binding
  • protein-containing complex binding
  • GTP binding
  • GMP binding
  • связывание с белками плазмы
  • GTPase activity
  • связывание похожих белков
Компонент клетки
  • цитоплазма
  • цитозоль
  • мембрана
  • фокальные контакты
  • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane
  • клеточная мембрана
  • митохондрия
  • липидный рафт
Биологический процесс
  • визуальное обучение
  • negative regulation of neuron apoptotic process
  • response to mineralocorticoid
  • positive regulation of protein phosphorylation
  • regulation of long-term neuronal synaptic plasticity
  • regulation of protein stability
  • epidermal growth factor receptor signaling pathway
  • positive regulation of MAP kinase activity
  • cytokine-mediated signaling pathway
  • negative regulation of cell differentiation
  • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway
  • response to glucocorticoid
  • MAPK cascade
  • Аксональное наведение
  • Fc-epsilon receptor signaling pathway
  • positive regulation of nitric-oxide synthase activity
  • forebrain astrocyte development
  • endocrine signaling
  • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
  • homeostasis of number of cells within a tissue
  • striated muscle cell differentiation
  • Ras protein signal transduction
  • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis
  • regulation of synaptic transmission, GABAergic
  • actin cytoskeleton organization
  • leukocyte migration
  • передача сигнала
  • positive regulation of Rac protein signal transduction
  • positive regulation of gene expression
  • позитивная регуляция пролиферации клеток
  • ERBB2 signaling pathway
  • развитие печени
  • positive regulation of cellular senescence
  • женская беременность
  • response to isolation stress
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

3845

16653

Ensembl

ENSG00000133703

ENSMUSG00000030265

UniProt

P01116

P32883

RefSeq (мРНК)

NM_004985
NM_033360
NM_001369786
NM_001369787

NM_021284

RefSeq (белок)

NP_004976
NP_203524
NP_001356715
NP_001356716
NP_004976.2

NP_067259
NP_001390169
NP_001390170
NP_001390171
NP_001390172

NP_001390173
NP_001390174
NP_001390175

Локус (UCSC)Chr 12: 25.21 – 25.25 MbChr 6: 145.16 – 145.2 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

KRAS — протоонкоген, представитель семейства белков Ras. Белок KRAS представляет собой ГТФазу и является компонентом многих путей передачи сигнала. KRAS имеет изопрениловую группу на С-конце и обычно связан с клеточными мембранами.

KRAS действует как «молекулярный переключатель», после включения он активирует белки, необходимые для распространения факторов роста и других путей, таких, как c-Raf и PI 3-kinase. KRAS связывает GTP в активном состоянии и может превращать его в GDP. После превращения GTP в GDP, белок KRAS «выключается». Скорость превращения обычно низкая, но может значительно повышаться при действии вспомогательных белков, усиливающих ГТФазную активность, например, RasGAP. KRAS в свою очередь может связываться с белками GEF, например, SOS1, которые облегчают освобождение связанных нуклеотидов. Соответственно, KRAS без нуклеотида легко связывает новые молекулы GTP или GDP из цитозоля. Ввиду того, что концентрация GTP в цитозоле значительно выше, чем GDP, это обычно приводит к активации KRAS.

Другие представители семейства белков Ras: HRAS, RRAS и NRAS. Эти белки подвергаются регуляции подобным образом, но работают в разных местах клетки.

Заболевания

Некоторые мутации KRAS в клетках зародышевого пути связаны с синдромом Нунан[5] и синдромом сердце-лицо-кожа (en:cardio-facio-cutaneous syndrome).[6]

Соматические мутации гена KRAS часто обнаруживают при лейкемиях, раке толстой кишки,[7] раке поджелудочной железы[8] и раке легких.[9] Определение мутационного статуса гена KRAS имеет значение при планировании терапии препаратами блокаторами EGFR, такими как цетуксимаб, в случае рака толстой кишки.[10] Мутация в гене KRAS обуславливает лиганд-независимую активацию пути передачи сигнала Ras/MAPK. Таким образом, карциномы с мутантным KRAS резистентны [11] к терапии анти-EGFR моноклональными антителами (панитумумаб, цетуксимаб, где «маб» — означает моноклональное антитело) и ингибиторами EGFR-TK (en:erlotinib, en:gefitinib).

Исследование KRAS

Анализ мутаций KRAS делают некоторые лаборатории на коммерческой основе.

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000133703 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030265 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Schubbert S., Zenker M., Rowe S. L., et al. Germline KRAS mutations cause Noonan syndrome (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2006. — Vol. 38, no. 3. — P. 331—336. — doi:10.1038/ng1748. — PMID 16474405.
  6. ↑ Niihori T., Aoki Y., Narumi Y., et al. Germline KRAS and BRAF mutations in cardio-facio-cutaneous syndrome (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2006. — Vol. 38, no. 3. — P. 294—296. — doi:10.1038/ng1749. — PMID 16474404.
  7. ↑ Burmer G. C., Loeb L. A. Mutations in the KRAS2 oncogene during progressive stages of human colon carcinoma (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1989. — Vol. 86, no. 7. — P. 2403—2407. — doi:10.1073/pnas.86.7.2403. — PMID 2648401.
  8. ↑ Almoguera C., Shibata D., Forrester K., Martin J., Arnheim N., Perucho M. Most human carcinomas of the exocrine pancreas contain mutant c-K-ras genes (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1988. — Vol. 53, no. 4. — P. 549—554. — doi:10.1016/0092-8674(88)90571-5. — PMID 2453289.
  9. ↑ Tam I. Y., Chung L. P., Suen W. S., et al. Distinct epidermal growth factor receptor and KRAS mutation patterns in non-small cell lung cancer patients with different tobacco exposure and clinicopathologic features (англ.) // Clin. Cancer Res.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 12, no. 5. — P. 1647—1653. — doi:10.1158/1078-0432.CCR-05-1981. — PMID 16533793.
  10. ↑ Lièvre A., Bachet J. B., Le Corre D., et al. KRAS mutation status is predictive of response to cetuximab therapy in colorectal cancer (англ.) // Cancer Research[англ.] : journal. — American Association for Cancer Research[англ.], 2006. — Vol. 66, no. 8. — P. 3992—3995. — doi:10.1158/0008-5472.CAN-06-0191. — PMID 16618717.
  11. ↑ EGF receptor  (неопр.). Дата обращения: 5 ноября 2007. Архивировано 25 марта 2012 года.

Литература

  • Kahn S., Yamamoto F., Almoguera C., et al. The c-K-ras gene and human cancer (review). (англ.) // Anticancer Res.[англ.] : journal. — 1987. — Vol. 7, no. 4A. — P. 639—652. — PMID 3310850.
  • Yamamoto F., Nakano H., Neville C., Perucho M. Structure and mechanisms of activation of c-K-ras oncogenes in human lung cancer. (англ.) // Prog. Med. Virol. : journal. — 1985. — Vol. 32. — P. 101—114. — PMID 3895297.
  • Porta M., Ayude D., Alguacil J., Jariod M. Exploring environmental causes of altered ras effects: fragmentation plus integration? (англ.) // Mol. Carcinog. : journal. — 2003. — Vol. 36, no. 2. — P. 45—52. — doi:10.1002/mc.10093. — PMID 12557259.
  • Smakman N., Borel Rinkes I. H., Voest E. E., Kranenburg O. Control of colorectal metastasis formation by K-Ras. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 103—114. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.07.001. — PMID 16098678.
  • Castagnola P., Giaretti W. Mutant KRAS, chromosomal instability and prognosis in colorectal cancer. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 115—125. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.06.003. — PMID 16112461.
  • Deramaudt T., Rustgi A. K. Mutant KRAS in the initiation of pancreatic cancer. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 97—101. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.08.003. — PMID 16169155.
  • Pretlow T. P., Pretlow T. G. Mutant KRAS in aberrant crypt foci (ACF): initiation of colorectal cancer? (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 83—96. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.06.002. — PMID 16219426.
  • Su Y. H., Wang M., Aiamkitsumrit B., et al. Detection of a K-ras mutation in urine of patients with colorectal cancer. (англ.) // Cancer biomarkers : section a of Disease markers : journal. — 2007. — Vol. 1, no. 2—3. — P. 177—182. — PMID 17192038.