EcoRV
| Restrikciona endonukleaza EcoRV | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 EcoRV kristalna struktura u kompleksu sa dvolančanom DNK[1] | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
| Simbol | Endonuc-EcoRV | ||||||||
| Pfam | PF09233 | ||||||||
| InterPro | IPR015314 | ||||||||
| SCOP | 1sx5 | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1sx5 | ||||||||
| |||||||||
 |
EcoRV je tip II restrikciona endonukleaza izolovana iz pojedinih vrsta Escherichia coli. Njegov alternativno ime je Eco32I.
EcoRV je često korišteni restrikcioni enzim u molekulskoj biologiji. On formira tupe krajeve. Ovaj enzim prepoznaje palindromsku šestobaznu DNK sekvencu ATC-3' i preseca oba lanca na istom mestu. Komplementarna sekvenca je TAG-5'. Nastali tupi krajevi se mogu se lako ligirati mada sa manjom efikasnošću od lepljivih krajeva.
Struktura
Struktura ovog enzima, i nekoliko mutanta, u kompleksu sa DNK sekvencom koju preseca je kristalografski rešena.
Osnova enzima se sastoji od petolančene mešovite β-ravni flankirane α-heliksima. Osnova je konzervirana u svim drugim restrikcionim endonukleazama tipa II. Ovaj enzim sadrži N-terminalni dimerizacioni domen formiran od kratkog α-heliksa, dvolančane antiparalne ravni i dugačkog α-heliksa. Taj domen je prisutan samo u EcoRV i PvuII.[2]
Reference
- ^ Dirk Kostrewa, Fritz K. Winkler (1995). „Mg2+ Binding to the Active Site of EcoRV Endonuclease: A Crystallographic Study of Complexes with Substrate and Product DNA at 2-.ANG. Resolution”. Biochemistry. 34 (2): 683—696. doi:10.1021/bi00002a036.
- ^ Pingoud A, Jeltsch A (2001). „Structure and function of type II restriction endonucleases”. Nucleic Acids Research. 29 (18): 3705—3727. PMC 55916
. PMID 11557805. doi:10.1093/nar/29.18.3705.
Literatura
- Nicholas C. Price; Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third изд.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
- Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 изд.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
- Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0.
- Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 изд.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097.
- William P. Jencks (1987). Catalysis in Chemistry and Enzymology. Dover Publications. ISBN 0486654605.
Vidi još
- EcoRI, nukleazni enzim iz E. coli.
- EcoRII, nukleazni enzim iz E. coli.
- FokI, nukleazni enzim iz Flavobacterium okeanokoites.
Spoljašnje veze
- п
- р
- у
- EC1 Oksidoreduktaze /spisak
- EC2 Transferaze /spisak
- EC3 Hidrolaze /spisak
- EC4 Lijaze /spisak
- EC5 Izomeraze /spisak
- EC6 Ligaze /spisak
- B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
Portali:
Molekularna i ćelijska biologija
Hemija
