DNM1L

DNM1L
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3W6N, 3W6O, 3W6P, 4BEJ, 4H1U, 4H1V

Ідентифікатори
Символи DNM1L, DLP1, DRP1, DVLP, DYMPLE, EMPF, HDYNIV, dynamin 1-like, dynamin 1 like, EMPF1, OPA5
Зовнішні ІД OMIM: 603850 MGI: 1921256 HomoloGene: 6384 GeneCards: DNM1L
Пов'язані генетичні захворювання
lethal encephalopathy due to mitochondrial and peroxisomal fission defect, optic atrophy[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• nucleotide binding
• protein homodimerization activity
• GTP binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• GO:0006184 GTPase activity
• identical protein binding
• hydrolase activity
• ubiquitin protein ligase binding
• lipid binding
• GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
• GTP-dependent protein binding
• microtubule binding
• clathrin binding
• GO:0032403 protein-containing complex binding
• BH2 domain binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• комплекс Ґольджі
• мембрана
• внутрішньоклітинна мембранна органела
• microtubule cytoskeleton
• пероксисома
• синапс
• synaptic vesicle membrane
• мітохондріальна зовнішня мембрана
• міжклітинні контакти
• мітохондрія
• brush border
• perinuclear region of cytoplasm
• clathrin-coated pit
• мікротрубочка
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• система ендомембран
• endoplasmic reticulum membrane
• Golgi membrane
• ендоплазматичний ретикулум
• мітохондріальна мембрана
• GO:0009327 protein-containing complex
• postsynapse
• presynaptic endocytic zone membrane
• mitochondrion-derived vesicle
• secretory vesicle

Біологічний процес

• mitochondrial fragmentation involved in apoptotic process
• regulation of ATP metabolic process
• positive regulation of mitochondrial fission
• ендоцитоз
• cellular component disassembly involved in execution phase of apoptosis
• mitochondrial fission
• regulation of mitochondrion organization
• regulation of protein oligomerization
• regulation of peroxisome organization
• membrane fusion
• peroxisome fission
• regulation of autophagy of mitochondrion
• positive regulation of protein secretion
• positive regulation of apoptotic process
• protein localization to mitochondrion
• positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria
• GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз
• dynamin family protein polymerization involved in mitochondrial fission
• heart contraction
• mitochondrion morphogenesis
• protein homotetramerization
• mitochondrial membrane fission
• positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway
• release of cytochrome c from mitochondria
• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
• protein complex oligomerization
• GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть
• mitochondrion organization
• endoplasmic reticulum organization
• apoptotic mitochondrial changes
• negative regulation of mitochondrial fusion
• synaptic vesicle recycling via endosome
• intracellular distribution of mitochondria
• synaptic vesicle endocytosis
• protein homooligomerization
• positive regulation of dendritic spine morphogenesis
• cellular response to lipid
• cellular response to oxygen-glucose deprivation
• execution phase of apoptosis
• positive regulation of synaptic vesicle endocytosis
• response to flavonoid
• response to hypobaric hypoxia
• positive regulation of synaptic vesicle exocytosis
• calcium ion transport
• регуляція експресії генів
• GO:1903834 regulation of ubiquitin protein ligase activity
• ритмічний процес

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10059
74006
Ensembl
ENSG00000087470
ENSMUSG00000022789
UniProt
O00429
Q8K1M6
RefSeq (мРНК)
NM_001278463
NM_001278464
NM_001278465
NM_001278466
NM_005690
NM_012062
NM_012063
NM_001330380
NM_001025947
NM_001276340
NM_001276341
NM_152816
NM_001360007
NM_001360008
NM_001360009
NM_001360010
RefSeq (білок)
NP_001265392
NP_001265393
NP_001265394
NP_001265395
NP_001317309
NP_005681
NP_036192
NP_036193
NP_001021118
NP_001263269
NP_001263270
NP_690029
NP_001346936
NP_001346937
NP_001346938
NP_001346939
NP_001392181
NP_001392182
NP_001392183
NP_001392184
NP_001392185
NP_001392186
NP_001392187
NP_001392188
NP_001392189
NP_001392190
NP_001392191
NP_001392192
NP_001392193
NP_001392194
Локус (UCSC) Хр. 12: 32.68 – 32.75 Mb Хр. 16: 16.13 – 16.18 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DNM1L (англ. Dynamin 1 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 736 амінокислот, а молекулярна маса — 81 877[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEALIPVINKLQDVFNTVGADIIQLPQIVVVGTQSSGKSSVLESLVGRDL
LPRGTGIVTRRPLILQLVHVSQEDKRKTTGEENGVEAEEWGKFLHTKNKL
YTDFDEIRQEIENETERISGNNKGVSPEPIHLKIFSPNVVNLTLVDLPGM
TKVPVGDQPKDIELQIRELILRFISNPNSIILAVTAANTDMATSEALKIS
REVDPDGRRTLAVITKLDLMDAGTDAMDVLMGRVIPVKLGIIGVVNRSQL
DINNKKSVTDSIRDEYAFLQKKYPSLANRNGTKYLARTLNRLLMHHIRDC
LPELKTRINVLAAQYQSLLNSYGEPVDDKSATLLQLITKFATEYCNTIEG
TAKYIETSELCGGARICYIFHETFGRTLESVDPLGGLNTIDILTAIRNAT
GPRPALFVPEVSFELLVKRQIKRLEEPSLRCVELVHEEMQRIIQHCSNYS
TQELLRFPKLHDAIVEVVTCLLRKRLPVTNEMVHNLVAIELAYINTKHPD
FADACGLMNNNIEEQRRNRLARELPSAVSRDKSSKVPSALAPASQEPSPA
ASAEADGKLIQDSRRETKNVASGGGGVGDGVQEPTTGNWRGMLKTSKAEE
LLAEEKSKPIPIMPASPQKGHAVNLLDVPVPVARKLSAREQRDCEVIERL
IKSYFLIVRKNIQDSVPKAVMHFLVNHVKDTLQSELVGQLYKSSLLDDLL
TESEDMAQRRKEAADMLKALQGASQIIAEIRETHLW

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ліпідами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, зовнішній мембрані мітохондрій, пероксисомах, апараті гольджі, синапсах.

Література

  • Shin H.-W., Shinotsuka C., Torii S., Murakami K., Nakayama K. (1997). Identification and subcellular localization of a novel mammalian dynamin-related protein homologous to yeast Vps1p and Dnm1p. J. Biochem. 122: 525—530. PMID 9348079 DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021784
  • Hong Y.-R., Chen C.-H., Cheng D.-S., Howng S.-L., Chow C.-C. (1998). Human dynamin-like protein interacts with the glycogen synthase kinase 3beta. Biochem. Biophys. Res. Commun. 249: 697—703. PMID 9731200 DOI:10.1006/bbrc.1998.9253
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Yoon Y., Pitts K.R., Dahan S., McNiven M.A. (1998). A novel dynamin-like protein associates with cytoplasmic vesicles and tubules of the endoplasmic reticulum in mammalian cells. J. Cell Biol. 140: 779—793. PMID 9472031 DOI:10.1083/jcb.140.4.779
  • Smirnova E., Shurland D.-L., Ryazantsev S.N., van der Bliek A.M. (1998). A human dynamin-related protein controls the distribution of mitochondria. J. Cell Biol. 143: 351—358. PMID 9786947 DOI:10.1083/jcb.143.2.351
  • Smirnova E., Griparic L., Shurland D.-L., van der Bliek A.M. (2001). Dynamin-related protein Drp1 is required for mitochondrial division in mammalian cells. Mol. Biol. Cell. 12: 2245—2256. PMID 11514614 DOI:10.1091/mbc.12.8.2245

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з DNM1L переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2973 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, O00429 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.