LGALS9

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EAK, 2EAL, 2YY1, 2ZHK, 2ZHL, 2ZHM, 2ZHN, 3LSD, 3LSE, 3NV1, 3NV2, 3NV3, 3NV4, 3WLU, 3WV6

Ідентифікатори

Символи

LGALS9, HUAT, LGALS9A, galectin 9

Зовнішні ІД

OMIM: 601879 HomoloGene: 32078 GeneCards: LGALS9

Онтологія гена
Молекулярна функція	• galactose binding • signal transducer activity • enzyme binding • disaccharide binding • carbohydrate binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • extracellular region • екзосома • цитоплазма • клітинне ядро • міжклітинний простір • гіалоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of interferon-gamma production • response to interleukin-1 • toll-like receptor 4 signaling pathway • maternal process involved in female pregnancy • positive regulation of T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell • процес імунної системи • positive regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell proliferation • ERK1 and ERK2 cascade • жіноча вагітність • positive regulation of viral entry into host cell • positive regulation of monocyte chemotactic protein-1 production • natural killer cell tolerance induction • negative regulation of chemokine production • regulation of interleukin-5 production • toll-like receptor 2 signaling pathway • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway • negative regulation of mast cell degranulation • negative regulation of gene expression • positive regulation of interleukin-4 production • хемотаксис • negative regulation of activated T cell proliferation • regulation of interleukin-4 production • response to lipopolysaccharide • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of dendritic cell apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to interferon-gamma • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • p38MAPK cascade • negative regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity • positive regulation of transforming growth factor beta production • negative regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell proliferation • positive regulation of dendritic cell differentiation • negative regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of CD4-positive, CD25-positive, alpha-beta regulatory T cell differentiation involved in immune response • inflammatory response • regulation of p38MAPK cascade • mature conventional dendritic cell differentiation • positive regulation of dendritic cell chemotaxis • positive regulation of activated T cell autonomous cell death
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3965


100124603

Ensembl


ENSG00000168961


ENSDARG00000087311

UniProt


O00182


A7E2L7

RefSeq (мРНК)


NM_002308 NM_009587 NM_001330163


NM_001102630

RefSeq (білок)


NP_001317092 NP_002299 NP_033665


NP_001096100

Локус (UCSC)

Хр. 17: 27.63 – 27.65 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LGALS9 (англ. Galectin 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 355 амінокислот, а молекулярна маса — 39 518^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAFSGSQAPY	LSPAVPFSGT	IQGGLQDGLQ	ITVNGTVLSS	SGTRFAVNFQ
TGFSGNDIAF	HFNPRFEDGG	YVVCNTRQNG	SWGPEERKTH	MPFQKGMPFD
LCFLVQSSDF	KVMVNGILFV	QYFHRVPFHR	VDTISVNGSV	QLSYISFQNP
RTVPVQPAFS	TVPFSQPVCF	PPRPRGRRQK	PPGVWPANPA	PITQTVIHTV
QSAPGQMFST	PAIPPMMYPH	PAYPMPFITT	ILGGLYPSKS	ILLSGTVLPS
AQRFHINLCS	GNHIAFHLNP	RFDENAVVRN	TQIDNSWGSE	ERSLPRKMPF
VRGQSFSVWI	LCEAHCLKVA	VDGQHLFEYY	HRLRNLPTIN	RLEVGGDIQL
THVQT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, хемотаксис, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі. Також секретований назовні.

Література

Tuereci O., Schmitt H., Fadle N., Pfreundschuh M., Sahin U. (1997). Molecular definition of a novel human galectin which is immunogenic in patients with Hodgkin's disease. J. Biol. Chem. 272: 6416—6422. PMID 9045665 DOI:10.1074/jbc.272.10.6416
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bi S., Hong P.W., Lee B., Baum L.G. (2011). Galectin-9 binding to cell surface protein disulfide isomerase regulates the redox environment to enhance T-cell migration and HIV entry. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 10650—10655. PMID 21670307 DOI:10.1073/pnas.1017954108
Heusschen R., Schulkens I.A., van Beijnum J., Griffioen A.W., Thijssen V.L. (2014). Endothelial LGALS9 splice variant expression in endothelial cell biology and angiogenesis. Biochim. Biophys. Acta. 1842: 284—292. PMID 24333696 DOI:10.1016/j.bbadis.2013.12.003
Hsu Y.L., Wang M.Y., Ho L.J., Huang C.Y., Lai J.H. (2015). Up-regulation of galectin-9 induces cell migration in human dendritic cells infected with dengue virus. J. Cell. Mol. Med. 19: 1065—1076. PMID 25754930 DOI:10.1111/jcmm.12500

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6570 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O00182 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.