OTUD7B

Ідентифікатори

Символи

OTUD7B, CEZANNE, ZA20D1, OTU deubiquitinase 7B

Зовнішні ІД

OMIM: 611748 MGI: 2654703 HomoloGene: 10624 GeneCards: OTUD7B

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • cysteine-type peptidase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • hydrolase activity • Lys48-specific deubiquitinase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• mucosal immune response • negative regulation of protein localization to nucleus • protein K48-linked deubiquitination • protein deubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process • процес імунної системи • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • протеоліз • negative regulation of interleukin-8 production • protein K63-linked deubiquitination • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • protein deubiquitination • protein K11-linked deubiquitination • адаптивна імунна відповідь
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56957


229603

Ensembl


ENSG00000264522


ENSMUSG00000038495

UniProt


Q6GQQ9


B2RUR8

RefSeq (мРНК)


NM_020205


NM_001025613 NM_001025614

RefSeq (білок)


NP_064590


NP_001020784 NP_001020785

Локус (UCSC)

Хр. 1: 149.94 – 150.01 Mb

Хр. 3: 96.01 – 96.07 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

OTUD7B (англ. OTU deubiquitinase 7B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 843 амінокислот, а молекулярна маса — 92 526^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTLDMDAVLS	DFVRSTGAEP	GLARDLLEGK	NWDVNAALSD	FEQLRQVHAG
NLPPSFSEGS	GGSRTPEKGF	SDREPTRPPR	PILQRQDDIV	QEKRLSRGIS
HASSSIVSLA	RSHVSSNGGG	GGSNEHPLEM	PICAFQLPDL	TVYNEDFRSF
IERDLIEQSM	LVALEQAGRL	NWWVSVDPTS	QRLLPLATTG	DGNCLLHAAS
LGMWGFHDRD	LMLRKALYAL	MEKGVEKEAL	KRRWRWQQTQ	QNKESGLVYT
EDEWQKEWNE	LIKLASSEPR	MHLGTNGANC	GGVESSEEPV	YESLEEFHVF
VLAHVLRRPI	VVVADTMLRD	SGGEAFAPIP	FGGIYLPLEV	PASQCHRSPL
VLAYDQAHFS	ALVSMEQKEN	TKEQAVIPLT	DSEYKLLPLH	FAVDPGKGWE
WGKDDSDNVR	LASVILSLEV	KLHLLHSYMN	VKWIPLSSDA	QAPLAQPESP
TASAGDEPRS	TPESGDSDKE	SVGSSSTSNE	GGRRKEKSKR	DREKDKKRAD
SVANKLGSFG	KTLGSKLKKN	MGGLMHSKGS	KPGGVGTGLG	GSSGTETLEK
KKKNSLKSWK	GGKEEAAGDG	PVSEKPPAES	VGNGGSKYSQ	EVMQSLSILR
TAMQGEGKFI	FVGTLKMGHR	HQYQEEMIQR	YLSDAEERFL	AEQKQKEAER
KIMNGGIGGG	PPPAKKPEPD	AREEQPTGPP	AESRAMAFST	GYPGDFTIPR
PSGGGVHCQE	PRRQLAGGPC	VGGLPPYATF	PRQCPPGRPY	PHQDSIPSLE
PGSHSKDGLH	RGALLPPPYR	VADSYSNGYR	EPPEPDGWAG	GLRGLPPTQT
KCKQPNCSFY	GHPETNNFCS	CCYREELRRR	EREPDGELLV	HRF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Bremm A., Freund S.M., Komander D. (2010). Lys11-linked ubiquitin chains adopt compact conformations and are preferentially hydrolyzed by the deubiquitinase Cezanne. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 939—947. PMID 20622874 DOI:10.1038/nsmb.1873
Garcia-Santisteban I., Banuelos S., Rodriguez J.A. (2012). A global survey of CRM1-dependent nuclear export sequences in the human deubiquitinase family. Biochem. J. 441: 209—217. PMID 21888622 DOI:10.1042/BJ20111300

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з OTUD7B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16683 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q6GQQ9 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.