犬冠狀病毒HuPn-2018

犬冠狀病毒HuPn-2018
病毒分類 编辑
（未分级）： 病毒 Virus
域： 核糖病毒域 Riboviria
界： 正核糖病毒界 Orthornavirae
门： 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲： 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目： 套式病毒目 Nidovirales
科： 冠状病毒科 Coronaviridae
属： 甲型冠狀病毒屬 Alphacoronavirus
种：
犬冠狀病毒HuPn-2018 甲型冠狀病毒1型
病毒：
犬冠狀病毒HuPn-2018 CCoV-HuPn-2018

犬冠狀病毒HuPn-2018（Canine coronavirus HuPn-2018，簡稱CCoV-HuPn-2018[註 1]）是甲型冠狀病毒1型的一個病毒株，由犬冠狀病毒（CCoV）與貓冠狀病毒（FCoV）經基因重組產生，為動物病毒發生病原溢出而感染人類的案例[1][2]。

發現

犬冠狀病毒HuPn-2018為自2017年－2018年馬來西亞沙勞越詩巫醫院8名住院的肺炎病患鼻腔檢體中發現，於2021年發表[1]。8名病患中有7名為偏鄉地區的5歲以下幼童（其中4人為1歲以下）[3]，可能是從家養或野生動物感染此病毒，其中7人同時還有感染其他病毒，經治療後均在一週內康復[4]。

病毒學

犬冠狀病毒HuPn-2018的基因組長29,083或29,351nt（因其中ORF7b基因序列有長短兩種型式而異），基因組結構與其他甲型冠狀病毒1型相同[1]。基因定序結果顯示此病毒株為犬冠狀病毒（CCoV） 與貓冠狀病毒（FCoV）融合而成，其基因組大部分與犬冠狀病毒TN-449毒株接近（相似度93.3%），與豬傳染性胃腸炎病毒（TGEV）Purdue毒株相似度91.5%，與貓冠狀病毒WSU 79-1683毒株相似度84.6%[註 2]。但編碼刺突蛋白的S基因中，S1序列與犬冠狀病毒的另一毒株（UCD-1）較接近（相似度99.2%），S2序列則與貓冠狀病毒WSU 79-1683毒株接近（相似度97.1%）。此外此病毒株編碼N蛋白的序列有長36nt（12個氨基酸）的刪除，不見於其他甲型冠狀病毒1型毒株，SARS-CoV的N蛋白也曾發生類似的刪除，可能與其傳播有關[1]。

後續研究顯示此病毒的刺突蛋白可與貓、狗與豬細胞表面的丙氨酸氨肽酶（AP-N）結合[註 3]，以其為受體感染細胞，雖正常情況下不能與人的AP-N結合，但有些人的AP-N可能因一個位點的SNP變異而可被此病毒結合，進而遭到感染[6]。此病毒S蛋白不具S1/S2位的弗林蛋白酶切割位點，因此屬於第二型的犬冠狀病毒（CCoV genotype II）[1]，但S2'中與其他二型犬冠狀病毒、貓冠狀病毒及豬傳染性胃腸炎病毒一樣具有弗林切割位點，可能也與其感染機制有關[6][7]。

相關病毒

犬冠狀病毒HuPn-2018可能為第8種已知可感染人類的冠狀病毒（其餘7種為造成普通感冒的人類冠狀病毒229E、人類冠狀病毒NL63、人類冠狀病毒OC43與人類冠狀病毒HKU1以及造成嚴重疾病的SARS-CoV、MERS-CoV與SARS-CoV-2）[1]。

除此病毒株外，還有數則研究報導過甲型冠狀病毒1型的病毒株從自然宿主（貓、狗與豬）發生病原溢出感染人類的情形[8]。2007年即有研究在2002年－2003年泰國曼谷醫院8名呼吸道感染的病人樣本中發現犬冠狀病毒[9]（但當時被誤鑑定為人類冠狀病毒229E[8]）；2014年有研究自2010年美國阿肯色州呼吸道感染的3名病人樣本中發現與貓冠狀病毒近似的病毒株[10]；2021年犬冠狀病毒HuPn-2018發表後不久，又有一與此病毒關係接近（刺突蛋白序列僅有2個氨基酸不同，全基因組序列相似度99.4%）的病毒株HuCCoV_Z19Haiti被發表，為自美國佛羅里達州一位甫自海地返國發病的病人中發現[8][11]。這些案例均顯示感染動物的甲型冠狀病毒可經快速演化與基因重組而發生病原溢出，導致偶發的人類感染，且造成症狀大多較為輕微[11]。

參見

註腳

  1. ^ 犬冠狀病毒-人肺炎-2018（Canine coronavirus–human pneumonia–2018）的簡稱[1]。
  2. ^ 以上病毒皆屬甲型冠狀病毒1型。
  3. ^ 犬冠狀病毒與人類冠狀病毒229E皆是以此蛋白為受體感染細胞[5]。

參考文獻

  • 病毒主题
  1. ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 Vlasova, Anastasia N.; Diaz, Annika; Damtie, Debasu; Xiu, Leshan; Toh, Teck-Hock; Lee, Jeffrey Soon-Yit; Saif, Linda J.; Gray, Gregory C. Novel Canine Coronavirus Isolated from a Hospitalized Pneumonia Patient, East Malaysia. Clinical Infectious Diseases. 2021, 74 (3): 446–454. PMC 8194511 可免费查阅. PMID 34013321. doi:10.1093/cid/ciab456. 
  2. ^ Pratelli A, Buonavoglia A, Lanave G, Tempesta M, Camero M, Martella V; et al. One world, one health, one virology of the mysterious labyrinth of coronaviruses: the canine coronavirus affair.. Lancet Microbe. 2021, 2 (12): e646–e647 [2023-02-05]. PMC 8577845 可免费查阅. PMID 34778852. doi:10.1016/S2666-5247(21)00282-2. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  3. ^ Lianna Matt McLernon. Another new coronavirus has jumped to people. CIDRAP News. 2021-05-20 [2023-02-05]. （原始内容存档于2022-12-08）. 
  4. ^ ALAYNA DEMARTINI. New Human Coronavirus CCoV-HuPn-2018 Identified – Originated in Dogs. SciTechDaily. 2021-05-23 [2023-02-04]. （原始内容存档于2022-08-08）. 
  5. ^ Zehr JD, Pond SLK, Martin DP, Ceres K, Whittaker GR, Millet JK; et al. Recent Zoonotic Spillover and Tropism Shift of a Canine Coronavirus Is Associated with Relaxed Selection and Putative Loss of Function in NTD Subdomain of Spike Protein.. Viruses. 2022, 14 (5) [2023-02-05]. PMC 9145938 可免费查阅. PMID 35632597. doi:10.3390/v14050853. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  6. ^ 6.0 6.1 Tortorici MA, Walls AC, Joshi A, Park YJ, Eguia RT, Miranda MC; et al. Structure, receptor recognition, and antigenicity of the human coronavirus CCoV-HuPn-2018 spike glycoprotein.. Cell. 2022, 185 (13): 2279–2291.e17 [2023-02-05]. PMC 9135795 可免费查阅. PMID 35700730. doi:10.1016/j.cell.2022.05.019. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  7. ^ Sanchari Sinha Dutta. Scientists characterize a novel zoonotic coronavirus in humans. News Medical. 2022-06-02 [2023-02-04]. （原始内容存档于2022-08-14）. 
  8. ^ 8.0 8.1 8.2 Vlasova AN, Toh TH, Lee JS, Poovorawan Y, Davis P, Azevedo MSP; et al. Animal alphacoronaviruses found in human patients with acute respiratory illness in different countries.. Emerg Microbes Infect. 2022, 11 (1): 699–702 [2023-02-05]. PMC 8890521 可免费查阅. PMID 35156544. doi:10.1080/22221751.2022.2040341. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  9. ^ Theamboonlers A, Samransamruajkit R, Thongme C, Amonsin A, Chongsrisawat V, Poovorawan Y. Human coronavirus infection among children with acute lower respiratory tract infection in Thailand.. Intervirology. 2007, 50 (2): 71–7. PMC 7179520 可免费查阅. PMID 17139182. doi:10.1159/000097392. 
  10. ^ Silva CS, Mullis LB, Pereira O, Saif LJ, Vlasova A, Zhang X; et al. Human Respiratory Coronaviruses Detected In Patients with Influenza-Like Illness in Arkansas, USA.. Virol Mycol. 2014, 2014 (Suppl 2) [2023-02-05]. PMC 5004774 可免费查阅. PMID 27588218. doi:10.4172/2161-0517.S2-004. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  11. ^ 11.0 11.1 Lednicky JA, Tagliamonte MS, White SK, Blohm GM, Alam MM, Iovine NM; et al. Isolation of a Novel Recombinant Canine Coronavirus From a Visitor to Haiti: Further Evidence of Transmission of Coronaviruses of Zoonotic Origin to Humans.. Clin Infect Dis. 2022, 75 (1): e1184–e1187 [2023-02-05]. PMC 9402678 可免费查阅. PMID 34718467. doi:10.1093/cid/ciab924. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  12. ^ Lednicky JA, Tagliamonte MS, White SK, Elbadry MA, Alam MM, Stephenson CJ; et al. Independent infections of porcine deltacoronavirus among Haitian children.. Nature. 2021, 600 (7887): 133–137 [2023-02-05]. PMC 8636265 可免费查阅. PMID 34789872. doi:10.1038/s41586-021-04111-z. （原始内容存档于2023-02-05）. 
  • 查
  • 论
  • 编
 
甲型冠狀病毒屬
（α-CoV）
甲型冠狀病毒1型
猫冠状病毒（FCoV） · 犬冠状病毒（CCoV）（犬冠狀病毒HuPn-2018） · 猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）
甲型冠狀病毒2型
雪貂冠狀病毒（FRECV · FRSCV） · 水鼬冠狀病毒（MCoV）
229E病毒
人類冠狀病毒229E（HCoV-229E） · 羊駝冠狀病毒（ACoV） · 單峰駱駝229E樣冠狀病毒 · 蝙蝠229E樣冠狀病毒
NL63病毒
人類冠狀病毒NL63（HCoV-NL63） · NL63相關蝙蝠冠狀病毒（英语：NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b）
長翼蝠冠狀病毒HKU8（Bat-CoV HKU8） · 長翼蝠冠狀病毒1型（Bat-CoV 1A/1B） · 褐扁顱蝠冠狀病毒HKU33（Tr-BatCoV HKU33）
蝙蝠冠狀病毒HKU10（Bat-CoV HKU10） · 马铁菊头蝠甲型冠状病毒HuB-2013（英语：Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013） · 中華菊頭蝠冠狀病毒HKU32（Rs-BatCoV HKU32） · 蝙蝠冠狀病毒CDPHE15（BatCoV CDPHE15） · 高頭蝠冠狀病毒512（Sc-BatCoV-512） · 猪流行性腹泻病毒（PEDV）
其他
鼩鼱冠狀病毒T14（Sa-CoV T14） · 文成鼩鼱病毒（WESV） · 鹿城褐家鼠冠状病毒（LRNV）
乙型冠狀病毒屬
（β-CoV）
Embecovirus（英语：Embecovirus）
（支系A）
乙型冠狀病毒1型（β1CoV）
牛冠狀病毒（BCoV） · 人類冠狀病毒OC43（HCoV-OC43） · 馬冠狀病毒（ECoV） · 豬凝血性腦脊髓炎病毒（PHEV） · 犬呼吸道冠狀病毒（CRCoV）
兔冠狀病毒HKU14（RbCoV HKU14） · 黃鼠冠狀病毒HKU24（ChRCoV HKU24） · 龍泉黑線姬鼠冠狀病毒（LAMV）
鼠冠狀病毒（M-CoV）
鼠肝炎病毒（MHV） · 大鼠冠狀病毒（RCoV）（大鼠涎淚腺炎病毒SDAV · 帕克RCoV）
人類冠狀病毒HKU1（HCoV-HKU1） · 龍泉羅賽鼠冠狀病毒（LRLV）
Merbecovirus（英语：Merbecovirus）
（支系C）
刺蝟冠狀病毒（EriCoV） · 東北刺蝟冠狀病毒HKU31（Ea-HedCoV HKU31） · 扁颅蝠冠状病毒HKU4（Bat-CoV HKU4） · 伏翼蝠冠状病毒HKU5（Bat-CoV HKU5） · 中東呼吸綜合症冠狀病毒（MERS-CoV） · 祖魯棕蝠冠狀病毒（NeoCoV） · 灰伏翼冠狀病毒HKU25（Hp-BatCoV HKU25）
Nobecovirus（英语：Nobecovirus）（支系D）
果蝠冠状病毒GCCDC1（Ro-BatCoV GCCDC1） · 果蝠冠状病毒HKU9（Ro-BatCoV HKU9）
Hibecovirus（英语：Hibecovirus）                            
普氏蹄蝠冠狀病毒ZJ013（BtHp-BetaCoV/ZJ2013）
Sarbecovirus（支系B）                            
SARS-CoV-1 · SARS-CoV-2 · 变种 · 蝙蝠SARSr-CoV（詳见Template:SARSr-CoV）
丙型冠状病毒属
（γ-CoV）
Cegacovirus
鯨豚冠狀病毒（白鯨冠狀病毒SW1 · 瓶鼻海豚冠狀病毒HKU22）
Brangacovirus（英语：Brangacovirus）
Igacovirus（英语：Igacovirus）
禽冠狀病毒（傳染性支氣管炎病毒） · 禽冠狀病毒9203（火雞冠狀病毒）
丁型冠狀病毒屬
（δ-CoV）
鵯冠狀病毒HKU11（BuCoV HKU11） · 鶇冠狀病毒HKU12（ThCoV HKU12） · 文鳥冠狀病毒HKU13（英语：Munia coronavirus HKU13）（MuCoV HKU13） · 猪丁型冠状病毒（PdCV） · 繡眼冠狀病毒HKU16（英语：White-eye coronavirus HKU16）（WeCoV HKU16） · 麻雀冠狀病毒HKU17（SpCoV HKU17） · 鵲鴝冠狀病毒HKU18（MRCoV HKU18） · 夜鷺冠狀病毒HKU19 · 鴨冠狀病毒HKU20（WiCoV HKU20） · 紅冠水雞冠狀病毒HKU21（英语：Common moorhen coronavirus HKU21）（CMCoV HKU21） · 隼冠狀病毒HKU27（FalCoV UAE-HKU27） · 翎頜鴇冠狀病毒HKU28（HouCoV UAE-HKU28） · 鴿冠狀病毒HKU29（PiCoV UAE-HKU29） · 鵪鶉冠狀病毒HKU30（QuaCoV UAE-HKU30）