リブロース-5-リン酸-3-エピメラーゼ

リブロース-5-リン酸-3-エピメラーゼ(Ribulose-phosphate 3-epimerase、EC 5.1.3.1)は、還元的ペントースリン酸回路において、D-リブロース-5-リン酸をD-キシルロース-5-リン酸に変換する酵素である。

D-リブロース-5-リン酸 ${\displaystyle \rightleftharpoons }$ D-キシルロース-5-リン酸

従って、この酵素の基質はD-リブロース-5-リン酸の1つ、生成物はD-キシルロース-5-リン酸の1つである。

この酵素は異性化酵素、特に炭水化物及びその類縁体に作用するラセマーゼ、エピメラーゼに分類される。

金属耐性細菌Cupriavidus metalliduransは、この酵素をコードする2つの遺伝子を持っていることが知られている^[1]。1つは染色体のP40117、もう1つはプラスミドのQ04539である。この酵素は、幅広い種類の細菌、古細菌、菌類、植物で見られる。全てのタンパク質は、209から241アミノ酸残基であり、TIMバレル構造を持つ。

この酵素の系統名は、D-リブロース-5-リン酸 3-エピメラーゼ(D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)である。PPEとも呼ばれる。

この酵素は、ペントースリン酸経路、ペントースとグルクロン酸の相互変換、炭酸固定の3つの代謝経路に関与している。

構造

2007年末時点で、4つの構造が解明されている。蛋白質構造データバンクのコードは、1H1Y、1H1Z、1RPX、1TQJである。

脚注

出典

• Ashwell G and Hickman J (1957). “Enzymatic formation of xylulose 5-phosphate from ribose 5-phosphate in spleen”. J. Biol. Chem. 226 (1): 65–76. PMID 13428737. 
• DICKENS F, WILLIAMSON DH (1956). “Pentose phosphate isomerase and epimerase from animal tissues”. Biochem. J. 64 (3): 567–78. PMC 1199776. PMID 13373810. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1199776/. 
• Hurwitz J and Horecker BL (1956). “The purification of phosphoketopentoepimerase from Lactobacillus pentosus and the preparation of xylulose 5-phosphate”. J. Biol. Chem. 223 (2): 993–1008. PMID 13385247. 
• Stumpf PK and Horecker BL (1956). “The roole of xylulose 5-phosphate in xylose metabolism of Lactobacillus pentosus”. J. Biol. Chem. 218: 753–768. 
• Terada T, Mukae H, Ohashi K, Hosomi S, Mizoguchi T, Uehara K (1985). “Characterization of an enzyme which catalyzes isomerization and epimerization of D-erythrose 4-phosphate”. Eur. J. Biochem. 148 (2): 345–51. doi:10.1111/j.1432-1033.1985.tb08845.x. PMID 3987693.