La saison 1999 du Championnat de Malaisie de football est la dix-huitième édition de la première division en Malaisie. Le championnat n'est en fait qu'une phase qualificative pour une compétition plus prestigieuse, la Coupe de Malaisie. Les dix meilleurs clubs engagés affrontent deux fois leurs adversaires, à domicile et à l'extérieur et seuls les six premiers se qualifient pour la phase finale de la Coupe de Malaisie, disputée sous forme de matchs à élimination directe. En fin de saison, pour permettre le passage du championnat de 10 à 12 équipes, le dernier est relégué et remplacé par les trois meilleurs clubs de deuxième division.
C'est le club de Pahang FA qui termine en tête du classement et qui remporte donc le titre officiel de champion de Malaisie. C'est le quatrième titre de l'histoire du club.
Une équipe étrangère, composée de joueurs de Brunei, participe également à la compétition.
Azman Adnan (13)
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