La saison 1999 du Championnat de Lituanie de football était la 10e édition de la première division lituanienne. Les 10 meilleurs clubs du pays sont regroupés en une poule unique où chaque équipe rencontre deux fois ses adversaires, à domicile et à l'extérieur. Cette saison sert de transition afin de permettre au championnat de passer au rythme des championnats nordiques, de mars à novembre.
Le FK Zalgiris Kaunas termine en tête du championnat cette saison. C'est le 1er titre de champion de Lituanie de son histoire.
Les 10 clubs participants
FK Zalgiris Vilnius
FK Ekranas Panevezys
FK Zalgiris Kaunas[1]
Banga Gargzdai
FK Inkaras Kaunas
Atlantas Klaipeda
Nevezis Kedainiai
Ardena Vilnius[2]
Dainava Alytus
Kareda Siauliai
Compétition
Le barème de points servant à établir le classement se décompose ainsi :