懸念される変異株

懸念される変異株（けねんされるへんいかぶ、英: variant of concern; VOC）は、新しく危険になったウイルスの変異株の初期評価を行う際に使われる分類である。これより前段階の、危険性のある変異株は「注目すべき変異株」（英: variant of interest; VOI）または「調査中の変異株」（英: variants under investigation; VUI）と分類されることがある[1]（#用語を参照）。懸念される変異株としてのより完全な評価がされると、変異株は Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages（英語版） における命名法で系統に紐づけされ[2]、Nextstrain（英語版）[3]やGISAIDのシステムでも分岐群として紐づけられる[4]。

新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) の世界的流行では、SARSコロナウイルス2 (SARS-CoV-2) の変異が観測され、特定の点突然変異の組み合わせのある変異株は他の変異株より懸念されるものとなっている[5]。これは基本再生産数や病原性の強さが主な理由となっており、免疫回避変異の出現の可能性なども加味されている。

用語

評価基準（後節も参照）を一つ以上満たす可能性のある変異株は「注目すべき変異株」（英: variant of interest; VOI）または「調査中の変異株」（英: variants under investigation; VUI）として、危険要素の検証が未了の変異株とみなされることがある。検証が済むと、VOIやVUIはCDCなどのモニタリング機関や世界保健機関 (WHO)、各国の保健機関などによって「懸念される変異株」（英: variant of concern; VOC）と改称され、特に危険性が高く警戒が必要な変異株とみなされる[1][5][6][7]。

また関連する分類として、CDCは「甚大な被害が想定される変異株」（英: variant of high consequence; VHC or VOHC）という分類を、特定の変異株に対する予防効果や治療効果が現に減少しているという証拠が明白なものについて用いている[8]。

この他、WHOは「さらなる監視のための警告」（英: alerts for further monitoring）という分類をVOIの評価基準には満たないが、将来的にリスクをもたらす可能性がある監視が必要な変異株に用いていた（VOIから格下げされ分類されることもある）[9]が、現在ではこれを「監視すべき変異株」（英: variants under monitoring; VUM）と呼称している[7][10]。

SARSコロナウイルス2

評価基準

SARSコロナウイルス2において、アメリカ合衆国のアメリカ疾病予防管理センター (CDC) やイギリスのイングランド公衆衛生サービス（英語版） (PHE)、英国COVID-19ゲノム協会（英語版）、カナダの COVID-19ゲノムネットワーク（CanCOGeN）といった、各国の国立・国際保健機関は、変異株の評価に以下の基準の一部または全部を使っている[11][12]。

  • 感染力の増大
  • 罹患率の増大
  • 致死率の増大
  • 後遺症リスクの増大
  • 検査での検出回避能力
  • 抗ウイルス薬（使用可能な場合のみ）の効能の減少
  • 回復期の血漿やモノクローナル抗体もしくは実験室での実験から推測した中和抗体生成の困難さ
  • 生体免疫回避能力（再感染の可能性など）
  • ワクチン接種を受けた者への影響可能性
  • 全身性炎症反応症候群や後遺症など、特定の状態の発現の可能性の増大
  • 子供や免疫不全の者など、特定の人口統計的または医学的な集団に対する親和性の増大

各国の例

イギリス

2021年3月5日現在、イギリスでは、PHEが新型コロナウイルスの4番目の変異株を、2月15日以降の16人の検査で陽性が確認されたのちにVUIに加えたため、VOCとVUI各4種、計8種の変異株が監視リストに入っている[13]。最新の変異株はVUI-21FEB-04 (Lineage B.1.1.318) で、2月24日にVUIに加わった。他のVUIはP.2、VUI-21FEB-01 (A.23.1 with E484K)、B.1.525で、VOCは B.1.1.7、B.1.351 (501.V2)、P.1、VOC-21FEB-02 (B.1.1.7 with E484K) である[14][15]。

2021年3月、PHEは変異株の命名に[YY][MMM]-[NN]の形式[注 1]を用いるよう変更した[16]。

アメリカ合衆国

アメリカでは、2021年2月にジャーナル・オブ・ジ・アメリカン・メディカル・アソシエーションの記事で、B.1.1.7、B.1.351 (501.V2)、P.1の3種のVOCが、「綿密に監視する必要のある変異株」として言及された[17]。

WHOによる分類

2022年2月以降、報告されるSARS-CoV-2ゲノムのほぼ全てを系統 B.1.1.529 (Omicron)とその亜系統・組み換え株が占めるようになった。WHOは、系統 B.1.1.529及びその亜系統・組み換え株を一括して「懸念される変異株 (VOC)」に分類していたが、2023年3月15日以降、オミクロン株亜系統・組み換え株のそれぞれについてリスク判断を行って分類することとしている[18][19][20]。

2023年5月17日現在、2種の「注目すべき変異株 (VOI) 」と7種の「監視すべき変異株 (VUM)」を選定している[7][19]。

注目すべき変異株 (VOI)

  • 系統XBB.1.5 (通称「クラーケン」[21]。XBBについて通称「グリフォン」がある[22])
  • 系統XBB.1.16（通称「アークトゥルス」[23]）

監視すべき変異株 (VUM)

  • 系統BQ.1（通称「ケルベロス」[22]）
  • 系統BA.2.75 (通称「ケンタウロス」[24])
  • 系統CH.1.1
  • 系統XBB (通称「グリフォン」がある[22])
  • 系統XBB.1.9.1
  • 系統XBF
  • 系統XBB.2.3

2023年3月15日以前の分類

2022年7月時点で、1種の「懸念される変異株 (VOC)」を選定している（※同時点で「注目すべき変異株 (VOI)」に選定されているものは存在しない）[25][9][10]。

懸念される変異株 (VOC)

その他

過去にVOCあるいはVOIに指定されラベル付けされたものの、上記の分類から除外された変異株[7][26]。

過去にVOCに選定
過去にVOIに選定

脚注

[脚注の使い方]

注釈

  1. ^ Yは年で2桁の数字、Mは月で3文字の略記、Nは通し番号で2桁の数字を用いる[16]。

出典

  1. ^ a b “Variants: distribution of cases data”. GOV.UK (2021年1月28日). 2021年2月19日閲覧。 “SARS-CoV-2 variants, if considered to have concerning epidemiological, immunological, or pathogenic properties, are raised for formal investigation. At this point they are designated Variant Under Investigation (VUI) with a year, month, and number. Following a risk assessment with the relevant expert committee, they may be designated Variant of Concern (VOC)”
  2. ^ Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á. (2020). “A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology”. Nature Microbiology 5 (11): 1403-1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. PMID 32669681. https://www.nature.com/articles/s41564-020-0770-5. 
  3. ^ “Updated Nextstrain SARS-CoV-2 clade naming strategy”. nextstrain.org/blog (2021年1月6日). 2021年1月19日閲覧。
  4. ^ “clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature')”. www.gisaid.org (2020年7月4日). 2021年1月7日閲覧。
  5. ^ a b “CanCOGeN Interim Recommendations for Naming, Identifying, and Reporting SARS-CoV-2 Variants of Concern” (PDF). CanCOGeN (nccid.ca) (2021年1月15日). 2021年2月25日閲覧。
  6. ^ Investigation of SARS-CoV-2 variants of concern in EnglandTechnical briefing 6 (PDF) 13 February 2021 (See section: Nomenclature of variants in the UK, P.3) assets.publishing.service.gov.uk, accessed 27 February 2021
  7. ^ a b c d “Tracking SARS-CoV-2 variants” (英語). World Health Organization (2023年5月18日). 2023年5月30日閲覧。
  8. ^ CDC (2020年2月11日). “Cases, Data, and Surveillance” (英語). Centers for Disease Control and Prevention. 2021年3月16日閲覧。
  9. ^ a b 感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規変異株について （第11報） - 国立感染症研究所 (2021年7月17日)、2021年8月15日閲覧。
  10. ^ a b 新型コロナウイルス感染症（変異株）の患者等の発生について - 厚生労働省 (2021年9月24日)、2021年9月29日閲覧。
  11. ^ Contributor, IDSA (2021年2月2日). “COVID “Mega-variant” and eight criteria for a template to assess all variants” (英語). Science Speaks: Global ID News. 2021年2月20日閲覧。
  12. ^ CDC. “Emerging SARS-CoV-2 Variants” (英語). Centers for Disease Control and Prevention. 2021年1月4日閲覧。  この記述には、アメリカ合衆国内でパブリックドメインとなっている記述を含む。
  13. ^ Covid-19: Another new variant added to UK watch list Michelle Roberts, 4 March 2021 www.bbc.com, accessed 5 March 2021
  14. ^ Variants of concern or under investigation: data up to 3 March 2021 4 March 2021 www.gov.uk, accessed 5 March 2021
  15. ^ Latest update: New Variant Under Investigation designated in the UK 4 March 2021 www.gov.uk, accessed 5 March 2021
  16. ^ a b Public Health England (2021年3月22日). “Variants: distribution of cases data” (英語). GOV.UK. 2021年3月22日閲覧。
  17. ^ SARS-CoV-2 Variants of Concern in the United States—Challenges and Opportunities 17 February 2021, jamanetwork.com, accessed 5 March 2021
  18. ^ “Statement on the update of WHO’s working definitions and tracking system for SARS-CoV-2 variants of concern and variants of interest” (英語). World Health Organization (2023年3月16日). 2023年3月27日閲覧。
  19. ^ a b “世界の新型コロナウイルス変異株流行状況（５月29日更新）”. 東京都健康安全研究センター (2023年5月29日). 2023年5月30日閲覧。
  20. ^ “感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の変異株について （第26報）”. 国立感染症研究所 (2023年3月24日). 2023年3月27日閲覧。
  21. ^ “新型コロナウイルスで“最強”とされる派生型「XBB.1.5（クラーケン）」について、いま知っておくべきこと”. WIRED (2023年1月27日). 2023年3月28日閲覧。
  22. ^ a b c “オミクロン株の新系統「グリフォン」「ケルベロス」、どんな特徴？　名前の由来は伝説”. 朝日新聞GLOBE＋ (2022年11月26日). 2023年3月27日閲覧。
  23. ^ “子どもが結膜炎になる新型コロナ変異株「アークトゥルス」とは”. Forbes JAPAN (2023年4月28日). 2023年5月7日閲覧。
  24. ^ “SARS-CoV-2オミクロンBA.2.75株（通称ケンタウロス）のウイルス学的性状の解明”. 東京大学医科学研究所. 2023年3月27日閲覧。
  25. ^ “Tracking SARS-CoV-2 variants” (英語). who.int. World Health Organization. 2022年7月1日時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年7月1日閲覧。
  26. ^ “当センターにおける新型コロナウイルス変異株のスクリーニング検査結果について（2021年10月12日更新）”. 東京都健康安全研究センター. 2021年10月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年10月13日閲覧。

外部リンク

  • SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions（英語） - CDC
  • Tracking SARS-CoV-2 variants（英語） - WHO
  • 感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の変異株について - 国立感染症研究所
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